| Honda FC | 83 |
| 佐川急便東京 | 75 |
| 佐川急便大阪 | 72 |
| YKK AP | 67 |
| ロッソ熊本 | 66 |
| 横河武蔵野 | 60 |
| 栃木SC | 60 |
| アローズ北陸 | 57 |
| ソニー仙台 | 37 |
| アルテ高崎 | 37 |
| SC鳥取 | 36 |
| ジェフ・クラブ | 35 |
| FC刈谷 | 32 |
| FC琉球 | 29 |
| 佐川印刷 | 29 |
| 流通経済大学 | 28 |
| 三菱水島FC | 27 |
| ホンダロック | 22 |
JFL（2006）得点ランク
（2006年12月3日現在）
| 順位 | 選手名 | 所属チーム | 得点 | (PK) | |||
| 1. | 大久保哲哉 | 26 | |||||
| 2. | 新田純也 | 24 | |||||
| 3. | 小林陽介 | 23 | |||||
| 4. | 北川佳男 | 22 | |||||
| 5. | 御給匠 | 21 | |||||
| 6. | 岸田裕樹 | 19 | |||||
| 7. | 内山英紀 | 17 | |||||
| 鈴木弘大 | 17 | ||||||
| 9. | 高橋泰 | 15 | |||||
| 10. | 堀健人 | 14 | |||||
| 11. | 河野将吾 | 12 | |||||
| 吉田賢太郎 | 12 | ||||||
| 13. | 長谷川満 | 11 | |||||
| 村山浩史 | 11 | ||||||
| 15. | 山本正男 | 10 | |||||
| 伊藤智弘 | 10 | ||||||
| 竹谷英之 | 10 | ||||||
| 町田多聞 | 10 | ||||||
| 水永翔馬 | 10 | ||||||
| 20. | 実信憲明 | 9 | |||||
| 本多進司 | 9 | ||||||
| 加藤知弘 | 9 | ||||||
| 中野隆治 | 9 | ||||||
| 堀徹也 | 9 | ||||||
| 25. | 朝比奈伸 | 8 | |||||
| 船山貴之 | 8 | ||||||
| 増本浩平 | 8 | ||||||
| 石橋直希 | 8 | ||||||
| 村田純平 | 8 | ||||||
| 金東秀 | 8 | ||||||
| 31. | 嶋田正吾 | 7 | |||||
| 星出悠 | 7 | ||||||
| 中村元 | 7 | ||||||
| 佐野智洋 | 7 | ||||||
| 黒田福太郎 | 7 | ||||||
| 松下和磨 | 7 | ||||||
| 原賀啓輔 | 7 | ||||||
| 38. | 米倉将文 | 6 | |||||
| 落合徳太 | 6 | ||||||
| 牛鼻健 | 6 | ||||||
| 熊谷雅彦 | 6 | ||||||
| 42. | 石原慎也 | 5 | |||||
| 関雅至 | 5 | ||||||
| 高松健太郎 | 5 | ||||||
| 町中大輔 | 5 | ||||||
| 松岡大輔 | 5 | ||||||
| 福嶋洋 | 5 | ||||||
| 川淵勇祐 | 5 | ||||||
| 石井雅之 | 5 | ||||||
| 浅野大地 | 5 | ||||||
| 黄学淳 | 5 | ||||||
| 52. | 中山康弘 | 4 | |||||
| 関光博 | 4 | ||||||
| 大多和卓 | 4 | ||||||
| 西原幹人 | 4 | ||||||
| 山本健二 | 4 | ||||||
| 高野和隆 | 4 | ||||||
| 山崎透 | 4 | ||||||
| 中払伸吾 | 4 | ||||||
| 濱野勇気 | 4 | ||||||
| 花渕修平 | 4 | ||||||
| 石田英之 | 4 | ||||||
| 金久保順 | 4 | ||||||
| 三門雄大 | 4 | ||||||
| 米山大輔 | 4 | ||||||
| 吉村和紘 | 4 | ||||||
| 関貴史 | 4 | ||||||
| 西川吉英 | 4 | ||||||
| 鎌田安啓 | 4 | ||||||
| 小林健史 | 4 | ||||||
| 川島大樹 | 4 | ||||||
| 鈴木滋 | 4 | ||||||
| 高秀賢史 | 4 | ||||||
| 木下健生 | 4 | ||||||
| タチコ | 4 | ||||||
| 森陽一 | 4 | ||||||
| 77. | 木村孝次 | 3 | |||||
| 管康介 | 3 | ||||||
| 谷内謙介 | 3 | ||||||
| 松本三四郎 | 3 | ||||||
| 東純一郎 | 3 | ||||||
| 小沼純矢 | 3 | ||||||
| 宮田知洋 | 3 | ||||||
| 野村正和 | 3 | ||||||
| 谷口研二 | 3 | ||||||
| 松岡真吾 | 3 | ||||||
| 平間智和 | 3 | ||||||
| 影山貴志 | 3 | ||||||
| 大西康平 | 3 | ||||||
| 片野寛理 | 3 | ||||||
| 西村英樹 | 3 | ||||||
| 大谷哲也 | 3 | ||||||
| 原島喬 | 3 | ||||||
| 久保田勲 | 3 | ||||||
| 田村和也 | 3 | ||||||
| 浅田祐史 | 3 | ||||||
| 大野寿久 | 3 | ||||||
| 細貝聡 | 3 | ||||||
| 小石龍臣 | 3 | ||||||
| 堀田利明 | 3 | ||||||
| 野澤和良 | 3 | ||||||
| 上園和明 | 3 | ||||||
| 福王忠世 | 3 | ||||||
| 下屋敷恒太郎 | 3 | ||||||
| 山下訓広 | 3 | ||||||
| クリスチアーノ | 3 | ||||||
| 阿部巧也 | 3 | ||||||
| 川前力也 | 3 | ||||||
| 本多剛 | 3 | ||||||
| 柏崎鷹信 | 3 | ||||||
| 平井晋太郎 | 3 | ||||||
| 武田英明 | 3 | ||||||
| 徐錫元 | 3 | ||||||
| ダニロ | 3 | ||||||
| 115. | 桐田英樹 | 2 | |||||
| 加納慎二郎 | 2 | ||||||
| 小田切道治 | 2 | ||||||
| 南光太 | 2 | ||||||
| 小幡正 | 2 | ||||||
| 阿達亮介 | 2 | ||||||
| 樋口龍 | 2 | ||||||
| 糸数昌太 | 2 | ||||||
| 石川雅人 | 2 | ||||||
| 高松剛太郎 | 2 | ||||||
| 大沢朋也 | 2 | ||||||
| 吉崎友二 | 2 | ||||||
| 貞富信宏 | 2 | ||||||
| 冨田晋矢 | 2 | ||||||
| 鵜飼宏長 | 2 | ||||||
| 田辺和彦 | 2 | ||||||
| 田尻元気 | 2 | ||||||
| 岡村政幸 | 2 | ||||||
| 小山大樹 | 2 | ||||||
| 比嘉リカルド | 2 | ||||||
| 山本翔平 | 2 | ||||||
| 石川大 | 2 | ||||||
| 市村篤司 | 2 | ||||||
| 篠川雅仁 | 2 | ||||||
| 河合崇泰 | 2 | ||||||
| 中森大介 | 2 | ||||||
| 野澤健一 | 2 | ||||||
| 榎本周平 | 2 | ||||||
| 船山祐二 | 2 | ||||||
| 市原充喜 | 2 | ||||||
| 儀間康太 | 2 | ||||||
| 西村俊寛 | 2 | ||||||
| 下木屋翔 | 2 | ||||||
| 成田順 | 2 | ||||||
| 田村洋平 | 2 | ||||||
| 山下聡也 | 2 | ||||||
| 朝日大輔 | 2 | ||||||
| 堀池勇平 | 2 | ||||||
| 澤口雅彦 | 2 | ||||||
| 池田圭 | 2 | ||||||
| 田中淳也 | 2 | ||||||
| 大槻紘士 | 2 | ||||||
| 斉藤紀由 | 2 | ||||||
| 城和憲 | 2 | ||||||
| 片山育男 | 2 | ||||||
| 戸田有悟 | 2 | ||||||
| 渡辺晋平 | 2 | ||||||
| 石川翔二 | 2 | ||||||
| 中島健太 | 2 | ||||||
| 平田順也 | 2 | ||||||
| 梁英二 | 2 | ||||||
| 田阪祐治 | 2 | ||||||
| 三宅一徳 | 2 | ||||||
| 大脇辰也 | 2 | ||||||
| 鶴岡学 | 2 | ||||||
| 金子剛 | 2 | ||||||
| 堤健吾 | 2 | ||||||
| 木村哲郎 | 2 | ||||||
| 川口正人 | 2 | ||||||
| 三好拓児 | 2 | ||||||
| 中田洋平 | 2 | ||||||
| 金載東 | 2 | ||||||
| 永井健太 | 2 | ||||||
| 178. | 赤井秀行 | 1 | |||||
| 小林羊汰 | 1 | ||||||
| 土屋貴啓 | 1 | ||||||
| 西弘則 | 1 | ||||||
| 西森正明 | 1 | ||||||
| 池田光忠 | 1 | ||||||
| 秋田英義 | 1 | ||||||
| 松原忠明 | 1 | ||||||
| 三原廣樹 | 1 | ||||||
| 高向隼人 | 1 | ||||||
| 山本朝陽 | 1 | ||||||
| 増田勝文 | 1 | ||||||
| 石川裕之 | 1 | ||||||
| 日高大樹 | 1 | ||||||
| 井戸川一徹 | 1 | ||||||
| 今井雅貴 | 1 | ||||||
| 河野太郎 | 1 | ||||||
| 安東利典 | 1 | ||||||
| 金正旭 | 1 | ||||||
| 西望実 | 1 | ||||||
| 金明輝 | 1 | ||||||
| 仲里航 | 1 | ||||||
| 沖本尚之 | 1 | ||||||
| 栗田泰次郎 | 1 | ||||||
| 岡田良瑞 | 1 | ||||||
| 高橋延仁 | 1 | ||||||
| 小林友綱 | 1 | ||||||
| 小関一平 | 1 | ||||||
| 吉田匡良 | 1 | ||||||
| 山田幸次郎 | 1 | ||||||
| ブルノ | 1 | ||||||
| 荒深翔 | 1 | ||||||
| 山根伸 | 1 | ||||||
| 千葉真也 | 1 | ||||||
| 和泉新 | 1 | ||||||
| 磯山和司 | 1 | ||||||
| 山崎邦夫 | 1 | ||||||
| 加藤韻 | 1 | ||||||
| 井上公平 | 1 | ||||||
| 冨山卓也 | 1 | ||||||
| 根本知治 | 1 | ||||||
| 檜垣信義 | 1 | ||||||
| 倉石圭二 | 1 | ||||||
| 蓮沼剛 | 1 | ||||||
| 茅島史彦 | 1 | ||||||
| 葛野昌宏 | 1 | ||||||
| 森一紘 | 1 | ||||||
| 1 | |||||||
| 谷田悠介 | 1 | ||||||
| 堀切良輔 | 1 | ||||||
| 桶田龍 | 1 | ||||||
| 趙光洙 | 1 | ||||||
| 小川雄司 | 1 | ||||||
| 藤木亮以 | 1 | ||||||
| 浅見和正 | 1 | ||||||
| 只木章広 | 1 | ||||||
| 伊藤勇士 | 1 | ||||||
| 矢部次郎 | 1 | ||||||
| 河村勝 | 1 | ||||||
| 池田竜市 | 1 | ||||||
| 山田智也 | 1 | ||||||
| 福島悟 | 1 | ||||||
| 藤吉信次 | 1 | ||||||
| 尹星二 | 1 | ||||||
| 野嶋良 | 1 | ||||||
| 張志旭 | 1 | ||||||
| 矢野大輔 | 1 | ||||||
| 大峽浩 | 1 | ||||||
| 楠瀬章仁 | 1 | ||||||
| 池上寿之 | 1 | ||||||
| 比嘉雄作 | 1 | ||||||
| 渡邉健雄 | 1 | ||||||
| 種倉寛 | 1 | ||||||
| 宮崎智彦 | 1 | ||||||
| 向島満 | 1 | ||||||
| 橋本尚樹 | 1 | ||||||
| 中垣雅博 | 1 | ||||||
| 藤倉寛 | 1 | ||||||
| 孫英植 | 1 | ||||||